Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGS1P23219 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms