Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FGFR3P22607 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FGFR3P22607 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms