Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GGTLC3B5MD39 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms