Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPACA6W5XKT8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPACA6W5XKT8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPACA6W5XKT8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPACA6W5XKT8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPACA6W5XKT8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPACA6W5XKT8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms