Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX49Q9Y6V7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms