Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00312Q9Y6C7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00312Q9Y6C7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00312Q9Y6C7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms