Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB12Q9Y5F1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB12Q9Y5F1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms