Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3HQ9Y535 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3HQ9Y535 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms