Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM50BQ9Y247 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM50BQ9Y247 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM50BQ9Y247 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms