Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP22Q9UPT9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP22Q9UPT9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP22Q9UPT9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms