Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH22Q9UJ99 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH22Q9UJ99 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms