Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC23A1Q9UHI7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC23A1Q9UHI7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms