Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SAE1Q9UBE0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SAE1Q9UBE0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAE1Q9UBE0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms