Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C6orf48Q9UBA6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms