Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00474Q9P2X8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00474Q9P2X8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00474Q9P2X8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms