Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUCLA2Q9P2R7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SUCLA2Q9P2R7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUCLA2Q9P2R7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SUCLA2Q9P2R7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SUCLA2Q9P2R7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms