Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOP53Q9NZM5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms