Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX95

SYBU, Syntabulin, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYBUQ9NX95 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYBUQ9NX95 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYBUQ9NX95 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYBUQ9NX95 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms