Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MED29Q9NX70 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED29Q9NX70 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED29Q9NX70 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms