Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TLR9Q9NR96 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLR9Q9NR96 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLR9Q9NR96 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TLR9Q9NR96 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms