Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BIN3Q9NQY0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BIN3Q9NQY0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms