Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MEPEQ9NQ76 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MEPEQ9NQ76 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEPEQ9NQ76 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms