Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9N2J8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9N2J8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9N2J8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9N2J8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9N2J8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9N2J8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9N2J8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9N2J8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9N2J8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9N2J8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9N2J8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9N2J8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9N2J8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9N2J8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9N2J8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9N2J8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9N2J8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9N2J8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9N2J8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9N2J8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9N2J8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9N2J8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9N2J8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9N2J8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9N2J8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9N2J8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9N2J8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9N2J8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9N2J8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9N2J8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9N2J8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9N2J8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9N2J8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9N2J8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9N2J8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9N2J8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9N2J8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9N2J8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9N2J8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9N2J8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9N2J8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9N2J8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9N2J8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9N2J8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9N2J8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9N2J8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9N2J8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9N2J8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9N2J8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9N2J8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9N2J8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9N2J8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9N2J8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9N2J8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9N2J8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9N2J8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9N2J8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9N2J8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9N2J8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9N2J8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9N2J8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9N2J8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9N2J8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9N2J8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9N2J8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9N2J8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9N2J8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9N2J8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9N2J8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9N2J8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9N2J8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9N2J8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9N2J8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9N2J8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9N2J8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9N2J8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9N2J8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9N2J8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9N2J8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9N2J8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9N2J8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms