Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPB41L5Q9HCM4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L5Q9HCM4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms