Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMURF2Q9HAU4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMURF2Q9HAU4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMURF2Q9HAU4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms