Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SENP3Q9H4L4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.8■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
SENP3Q9H4L4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SENP3Q9H4L4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms