Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REPIN1Q9BWE0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms