Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP58Q9BVL2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP58Q9BVL2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms