Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PI4K2AQ9BTU6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PI4K2AQ9BTU6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms