Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFJQ9BTM1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFJQ9BTM1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFJQ9BTM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms