Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTA3Q9BTC8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTA3Q9BTC8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTA3Q9BTC8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms