Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBGCP2Q9BSJ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBGCP2Q9BSJ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms