Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GAL3ST1Q99999 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GAL3ST1Q99999 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GAL3ST1Q99999 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms