Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LYSTQ99698 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LYSTQ99698 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYSTQ99698 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms