Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OTUB1Q96FW1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OTUB1Q96FW1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OTUB1Q96FW1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms