Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRPL53Q96EL3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRPL53Q96EL3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms