Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RMDN1Q96DB5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RMDN1Q96DB5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RMDN1Q96DB5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms