Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC11Q96DB2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC11Q96DB2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC11Q96DB2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms