Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC58Q96CX6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC58Q96CX6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC58Q96CX6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms