Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAF2Q96CS3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAF2Q96CS3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms