Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms