Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP6V1E2Q96A05 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1E2Q96A05 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1E2Q96A05 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms