Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2A3Q93084 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A3Q93084 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms