Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BRF1Q92994 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRF1Q92994 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRF1Q92994 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRF1Q92994 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRF1Q92994 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRF1Q92994 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRF1Q92994 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRF1Q92994 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BRF1Q92994 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRF1Q92994 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BRF1Q92994 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRF1Q92994 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRF1Q92994 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms