Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEL6

TRPC4AP, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4APQ8TEL6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC4APQ8TEL6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC4APQ8TEL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC4APQ8TEL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC4APQ8TEL6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC4APQ8TEL6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms