Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTRT1Q8TDG2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTRT1Q8TDG2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACTRT1Q8TDG2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms