Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3L4Q8TBR4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STAG3L4Q8TBR4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms