Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATJQ8NI35 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATJQ8NI35 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PATJQ8NI35 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATJQ8NI35 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATJQ8NI35 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATJQ8NI35 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATJQ8NI35 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATJQ8NI35 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PATJQ8NI35 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PATJQ8NI35 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATJQ8NI35 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATJQ8NI35 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATJQ8NI35 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATJQ8NI35 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATJQ8NI35 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATJQ8NI35 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATJQ8NI35 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATJQ8NI35 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms