Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BHLHE22Q8NFJ8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BHLHE22Q8NFJ8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE22Q8NFJ8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms