Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF397Q8NF99 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF397Q8NF99 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF397Q8NF99 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms